Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRDCB7Z8K6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRDCB7Z8K6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms