Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SOBPA7XYQ1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SOBPA7XYQ1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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