Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD3A6NKT7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGPD3A6NKT7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms