Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
C9orf92A6NGG3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf92A6NGG3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf92A6NGG3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf92A6NGG3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf92A6NGG3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf92A6NGG3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf92A6NGG3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf92A6NGG3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf92A6NGG3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf92A6NGG3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf92A6NGG3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf92A6NGG3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf92A6NGG3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf92A6NGG3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf92A6NGG3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf92A6NGG3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf92A6NGG3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf92A6NGG3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf92A6NGG3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf92A6NGG3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf92A6NGG3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf92A6NGG3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf92A6NGG3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf92A6NGG3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf92A6NGG3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf92A6NGG3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf92A6NGG3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf92A6NGG3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf92A6NGG3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf92A6NGG3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
C9orf92A6NGG3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms