Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CNTN3Q9P232 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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