Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CUL4AQ13619 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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CUL4AQ13619 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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CUL4AQ13619 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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CUL4AQ13619 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4AQ13619 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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