Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCAPQ12770 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms