Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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SALL4Q9UJQ4 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL4Q9UJQ4 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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