Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
TRAPPC9Q96Q05 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TRAPPC9Q96Q05 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms