Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
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FOXD4Q12950 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
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FOXD4Q12950 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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FOXD4Q12950 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXD4Q12950 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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