Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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PTPN13Q12923 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
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PTPN13Q12923 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
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PTPN13Q12923 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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PTPN13Q12923 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPN13Q12923 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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