Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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CENPFP49454 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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CENPFP49454 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CENPFP49454 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CENPFP49454 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CENPFP49454 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CENPFP49454 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CENPFP49454 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CENPFP49454 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CENPFP49454 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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CENPFP49454 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CENPFP49454 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CENPFP49454 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CENPFP49454 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CENPFP49454 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CENPFP49454 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
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