Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TIMMDC1Q9NPL8 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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