Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 AC084816.1-202ENST00000536744 647 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SPOCK3Q9BQ16 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms