Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 BBOX1-201ENST00000263182 1886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 MSL3-206ENST00000380693 2377 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 EPHA4-201ENST00000281821 6346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 CU638689.4-201ENST00000623047 5990 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 ZHX3-201ENST00000309060 10030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 SRFBP1-201ENST00000339397 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 NBEA-202ENST00000379922 3794 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 CXCR6-204ENST00000458629 2805 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AL356364.1-201ENST00000458443 182 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 NPIPB5-209ENST00000517539 3569 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 SCAND2P-201ENST00000348993 8975 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 RBM46-201ENST00000281722 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC244502.1-201ENST00000514473 1951 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 DDX42-203ENST00000457800 3323 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 ZNF844-202ENST00000441304 2036 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 GPR1-AS-201ENST00000623040 3708 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 RPL24P4-201ENST00000326586 421 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 PPIAP22-201ENST00000358455 498 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 RPL34P19-201ENST00000415903 342 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 LINC00222-203ENST00000416890 602 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 RN7SL180P-201ENST00000466769 294 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC011333.1-201ENST00000520587 436 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 MIR4470-201ENST00000583453 72 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 ZNF675-204ENST00000599168 592 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 JAML-213ENST00000640745 951 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 AL356585.10-201ENST00000641883 123 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 CORO1C-202ENST00000420959 3921 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
MKRN4PQ13434 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
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