Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
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