Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SHOC2Q9UQ13 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms