Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TOP3AQ13472 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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TOP3AQ13472 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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TOP3AQ13472 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TOP3AQ13472 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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