Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
TRHP20396 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
TRHP20396 ASB15-206ENST00000451558 4788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TRHP20396 NRXN1-206ENST00000402717 2508 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TRHP20396 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TRHP20396 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TRHP20396 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TRHP20396 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TRHP20396 ATP2C1-208ENST00000504948 4714 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TRHP20396 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TRHP20396 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
TRHP20396 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
TRHP20396 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRHP20396 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRHP20396 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRHP20396 MID1-212ENST00000616003 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRHP20396 LINC02431-202ENST00000505329 1788 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRHP20396 DHX57-203ENST00000457308 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRHP20396 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRHP20396 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRHP20396 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TRHP20396 VPS8-210ENST00000446204 4721 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRHP20396 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TRHP20396 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TRHP20396 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRHP20396 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRHP20396 BOLL-204ENST00000430004 2987 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRHP20396 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TRHP20396 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRHP20396 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TRHP20396 SAA3P-201ENST00000533267 365 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TRHP20396 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRHP20396 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TRHP20396 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRHP20396 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRHP20396 ABCC4-201ENST00000376887 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRHP20396 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRHP20396 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRHP20396 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TRHP20396 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRHP20396 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRHP20396 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRHP20396 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRHP20396 ZNF445-202ENST00000425708 10052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRHP20396 GFPT1-201ENST00000357308 8703 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TRHP20396 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRHP20396 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TRHP20396 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TRHP20396 FSD1L-202ENST00000374710 7664 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRHP20396 DNAJC6-201ENST00000263441 5916 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRHP20396 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRHP20396 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRHP20396 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRHP20396 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRHP20396 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TRHP20396 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRHP20396 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TRHP20396 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TRHP20396 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TRHP20396 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TRHP20396 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TRHP20396 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRHP20396 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRHP20396 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TRHP20396 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TRHP20396 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TRHP20396 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TRHP20396 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRHP20396 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRHP20396 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRHP20396 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRHP20396 MID1-204ENST00000380782 3352 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRHP20396 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRHP20396 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRHP20396 ZNF841-203ENST00000594295 3819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRHP20396 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRHP20396 NXT2-203ENST00000372106 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRHP20396 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TRHP20396 RPS17-209ENST00000561157 1909 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TRHP20396 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TRHP20396 OR2T35-202ENST00000641268 2957 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TRHP20396 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TRHP20396 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TRHP20396 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TRHP20396 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TRHP20396 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TRHP20396 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TRHP20396 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TRHP20396 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TRHP20396 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TRHP20396 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TRHP20396 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TRHP20396 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TRHP20396 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TRHP20396 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TRHP20396 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TRHP20396 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
TRHP20396 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TRHP20396 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TRHP20396 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms