Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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VPS72Q15906 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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VPS72Q15906 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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VPS72Q15906 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
VPS72Q15906 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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