Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
AP3B2Q13367 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
AP3B2Q13367 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms