Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC084816.1-202ENST00000536744 647 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 GOLGA6L5P-203ENST00000559768 578 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN3Q13064 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
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