Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 AC009869.1-201ENST00000530418 528 ntTSL 4 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 TGFB3-AS1-201ENST00000553732 580 ntTSL 4 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 AL121820.1-201ENST00000556919 461 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 PPARA-201ENST00000262735 9965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 GOLGB1-209ENST00000614479 11115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 CHRM3-201ENST00000255380 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 AP2B1-213ENST00000612116 3483 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 OR2T12-202ENST00000641276 5708 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 PKHD1-201ENST00000340994 11589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 AC113615.1-201ENST00000507424 4121 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 LINC02150-201ENST00000513157 2120 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 LINC01358-207ENST00000634502 2575 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 IL12B-201ENST00000231228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 ZNF844-202ENST00000441304 2036 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 LRRC37A9P-201ENST00000603850 5376 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 ZNF226-213ENST00000588883 5972 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 IGHV4-34-201ENST00000390616 400 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 AL353151.1-201ENST00000402406 604 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 U3.31-201ENST00000408113 216 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 ZEB1-AS1-202ENST00000424191 320 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 DDX11L10-201ENST00000430178 571 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 RPS21P1-201ENST00000434479 247 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 RPL7AP56-201ENST00000476420 791 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 AC233724.10-201ENST00000510454 409 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 SCARNA20.1-201ENST00000516009 138 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 MIR4642-201ENST00000583943 82 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 AC004852.1-201ENST00000605206 154 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 PPP2R2B-202ENST00000394409 10704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 CD101-202ENST00000369470 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 ESRP1-201ENST00000358397 3756 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 SLC30A8-205ENST00000519688 5242 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 SMARCA2-252ENST00000636559 6853 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 PFKFB1-203ENST00000545676 1591 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 KLHL2-209ENST00000514860 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 JAZF1-201ENST00000283928 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 AL008638.3-201ENST00000623027 5182 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 GINS4-201ENST00000276533 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 DEFA6-201ENST00000297436 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 RNA5SP448-201ENST00000363151 111 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 RN7SKP207-201ENST00000411204 303 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 AC099344.1-201ENST00000433548 492 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 AL357552.2-201ENST00000433876 353 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 AC084878.1-201ENST00000480555 648 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 RNA5SP287-201ENST00000516358 103 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 AP003119.2-201ENST00000528075 336 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 AP004833.3-201ENST00000531893 322 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 LINC01742-201ENST00000616333 628 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 IL13-206ENST00000617259 498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 ZNF585B-204ENST00000531805 2971 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
CACNB1Q02641 CHAF1B-201ENST00000314103 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms