Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPREP23469 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPREP23469 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPREP23469 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPREP23469 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPREP23469 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPREP23469 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPREP23469 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPREP23469 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPREP23469 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPREP23469 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPREP23469 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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PTPREP23469 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPREP23469 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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PTPREP23469 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPREP23469 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPREP23469 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPREP23469 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPREP23469 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPREP23469 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPREP23469 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPREP23469 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPREP23469 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPREP23469 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPREP23469 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPREP23469 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPREP23469 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPREP23469 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPREP23469 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPREP23469 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPREP23469 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPREP23469 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPREP23469 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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