Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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HOXD8P13378 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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