Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CAPN6Q9Y6Q1 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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