Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.3 ms