Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CASQ1P31415 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CASQ1P31415 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CASQ1P31415 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CASQ1P31415 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CASQ1P31415 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CASQ1P31415 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CASQ1P31415 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
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CASQ1P31415 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CASQ1P31415 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CASQ1P31415 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CASQ1P31415 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CASQ1P31415 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CASQ1P31415 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CASQ1P31415 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CASQ1P31415 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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CASQ1P31415 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CASQ1P31415 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CASQ1P31415 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
CASQ1P31415 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
CASQ1P31415 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.84
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CASQ1P31415 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CASQ1P31415 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
CASQ1P31415 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CASQ1P31415 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CASQ1P31415 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CASQ1P31415 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CASQ1P31415 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CASQ1P31415 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CASQ1P31415 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CASQ1P31415 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CASQ1P31415 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CASQ1P31415 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CASQ1P31415 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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CASQ1P31415 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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CASQ1P31415 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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CASQ1P31415 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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CASQ1P31415 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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CASQ1P31415 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CASQ1P31415 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CASQ1P31415 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CASQ1P31415 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CASQ1P31415 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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CASQ1P31415 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CASQ1P31415 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CASQ1P31415 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CASQ1P31415 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CASQ1P31415 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CASQ1P31415 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CASQ1P31415 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CASQ1P31415 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CASQ1P31415 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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CASQ1P31415 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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CASQ1P31415 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CASQ1P31415 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CASQ1P31415 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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CASQ1P31415 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CASQ1P31415 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CASQ1P31415 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CASQ1P31415 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CASQ1P31415 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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