Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PTPREP23469 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
PTPREP23469 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
PTPREP23469 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPREP23469 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPREP23469 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPREP23469 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPREP23469 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPREP23469 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPREP23469 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPREP23469 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPREP23469 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPREP23469 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPREP23469 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPREP23469 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPREP23469 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPREP23469 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPREP23469 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPREP23469 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPREP23469 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPREP23469 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPREP23469 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPREP23469 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPREP23469 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPREP23469 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms