Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.3 ms