Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LAMA3Q16787 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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