Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIXQ14938 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIXQ14938 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms