Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MTERF4-205ENST00000407095 799 ntTSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 CDY2A-202ENST00000426790 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 RN7SL251P-201ENST00000464175 297 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 CDY2B-202ENST00000544303 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 RBM4-213ENST00000578778 582 ntTSL 4 BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 LAMTOR5-AS1-248ENST00000630488 703 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 ESRP1-201ENST00000358397 3756 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 SLFN12L-201ENST00000260908 3119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 NRXN1-206ENST00000402717 2508 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 MAPK10-242ENST00000639242 3088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
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MKRN4PQ13434 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 C18orf32-203ENST00000613385 5395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
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MKRN4PQ13434 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC8.15□□□□□ -1.1
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MKRN4PQ13434 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.1
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MKRN4PQ13434 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
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MKRN4PQ13434 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
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MKRN4PQ13434 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
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MKRN4PQ13434 SP110-203ENST00000358662 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
MKRN4PQ13434 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 NLRC4-204ENST00000404025 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 ARHGEF7-208ENST00000426073 4921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 KIAA1143-201ENST00000296121 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 VWA3A-202ENST00000389398 4600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN4PQ13434 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
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