Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
IFT88Q13099 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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