Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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USP18Q9UMW8 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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USP18Q9UMW8 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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USP18Q9UMW8 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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USP18Q9UMW8 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
USP18Q9UMW8 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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