Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ATP1A4Q13733 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
ATP1A4Q13733 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms