Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CHRNEQ04844 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms