Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4Q9P0V3 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4Q9P0V3 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
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