Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC010480.1-201ENST00000624823 684 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPN13Q12923 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms