Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPREP23469 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPREP23469 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
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