Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X0

SETBP1, SET-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETBP1Q9Y6X0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SETBP1Q9Y6X0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETBP1Q9Y6X0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms