Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMED7Q9Y3B3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMED7Q9Y3B3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms