Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

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Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP20Q9Y2K6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP20Q9Y2K6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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