Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF6Q9Y252 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF6Q9Y252 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF6Q9Y252 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF6Q9Y252 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF6Q9Y252 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF6Q9Y252 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF6Q9Y252 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF6Q9Y252 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF6Q9Y252 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF6Q9Y252 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF6Q9Y252 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF6Q9Y252 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF6Q9Y252 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF6Q9Y252 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF6Q9Y252 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF6Q9Y252 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms