Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGTPBP1Q9UPW5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGTPBP1Q9UPW5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms