Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP45Q9UL16 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms