Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYH13Q9UKX3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYH13Q9UKX3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms