Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHIC2Q9UKJ5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CHIC2Q9UKJ5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms