Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP21Q9UK80 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms