Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN11AQ9UI33 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN11AQ9UI33 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms